19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3017 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  71.93 
 
 		 318 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  65.52 
 
 		 318 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  65.52 
 
 		 318 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  67.27 
 
 		 318 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  61.4 
 
 		 313 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  61.02 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.93 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  63.16 
 
 		 314 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  60 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  58.33 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  60.71 
 
 		 315 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  59.26 
 
 		 317 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  59.26 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  56.67 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  54.55 
 
 		 322 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  52.54 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  63.64 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  65.85 
 
 		 314 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>