More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1422 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  100 
 
 		 322 aa  664    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  72.15 
 
 		 321 aa  497  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  60.76 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  58.41 
 
 		 313 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.01 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  53.8 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  56.37 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  52.83 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  52.2 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  51.11 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  51.86 
 
 		 318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  52.53 
 
 		 312 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  54.55 
 
 		 316 aa  328  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  49.84 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  49.33 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 318 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  51.41 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  52.05 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.43 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.36 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  54.55 
 
 		 64 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  24.75 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  31.58 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  25.97 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  23.27 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 495 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 470 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  24.63 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  28.5 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.94 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.68 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3402  oxidoreductase, putative  26.62 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.35 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.35 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.32 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.93 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  23.53 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  28.37 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  23.53 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  21.94 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  23.5 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  27.05 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  23.47 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  23.53 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  23.53 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>