More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0842 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  100 
 
 		 325 aa  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  60.19 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  58.64 
 
 		 326 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  57.1 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.17 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  55.08 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  55.56 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  55.08 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  55.86 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  55.08 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  55.08 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  55.08 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  55.08 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  55.08 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  55.08 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  55.08 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  56.62 
 
 		 324 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  54.15 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  53.85 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  53.85 
 
 		 332 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  54.15 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  54.15 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  52.47 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  52.78 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  51.53 
 
 		 327 aa  331  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  49.39 
 
 		 328 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  41.72 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  34.39 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  35.98 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  35.12 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  33.93 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.68 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  29.32 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  26.52 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  28.06 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.13 
 
 		 327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 329 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  27.36 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  27.61 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  32.57 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 667 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  25.66 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 		 327 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  32.06 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.61 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.02 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  26.06 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.42 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.02 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  28.23 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 665 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  32.51 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 354 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  28.32 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  33.97 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 356 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  33.9 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  24.44 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  23.72 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.28 
 
 		 670 aa  89  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>