More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4401 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  98.48 
 
 		 334 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  98.17 
 
 		 328 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  98.78 
 
 		 328 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  98.17 
 
 		 328 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  98.78 
 
 		 328 aa  670    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  100 
 
 		 328 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  98.17 
 
 		 328 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  98.48 
 
 		 334 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  98.78 
 
 		 328 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  82.82 
 
 		 332 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  82.82 
 
 		 332 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  83.13 
 
 		 344 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  82.82 
 
 		 332 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  83.13 
 
 		 344 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  83.44 
 
 		 332 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  73.77 
 
 		 326 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  74.15 
 
 		 331 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  73.85 
 
 		 331 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  73.85 
 
 		 331 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  70.46 
 
 		 332 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  70.77 
 
 		 332 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  57.54 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  55.08 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  51.52 
 
 		 329 aa  341  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  49.54 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  47.89 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  44.95 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  33.63 
 
 		 334 aa  195  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  34.43 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  32.44 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  32.15 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  35.59 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.8 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  28.81 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  27.88 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  29.87 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.13 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  27.92 
 
 		 358 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  27.46 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  25.68 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  27.71 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.47 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.22 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  24.07 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.31 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 667 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  22.87 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 352 aa  95.9  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  26.55 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  27.72 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 367 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  25.64 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  23.28 
 
 		 326 aa  86.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  24.77 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 360 aa  85.9  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  25.07 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.38 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>