More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0535 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 332 aa  694    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  95.48 
 
 		 332 aa  666    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  72.48 
 
 		 332 aa  504  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  72.31 
 
 		 326 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  71.38 
 
 		 328 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  71.08 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  71.08 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  71.38 
 
 		 328 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  70.77 
 
 		 328 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  70.77 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  70.77 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  70.77 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  70.77 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  68.81 
 
 		 344 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  68.81 
 
 		 332 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  68.81 
 
 		 332 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  69.3 
 
 		 331 aa  474  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  68.5 
 
 		 332 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  68.5 
 
 		 344 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  57.1 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  52.78 
 
 		 325 aa  359  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  53.09 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  50.61 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  48.47 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  44.68 
 
 		 332 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  38.44 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  37.8 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  37.01 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  32.55 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.08 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  30.93 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  29.22 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  30.07 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  27.88 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  29.29 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  28.48 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.97 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  25.53 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.78 
 
 		 359 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  24.77 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.8 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  25.15 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  27.04 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.77 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  26.04 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 667 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  21.95 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.49 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.49 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 342 aa  89.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 		 332 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 665 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 435 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  23.12 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>