More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2396 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 431 aa  902    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  94.87 
 
 		 431 aa  862    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  61.32 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  53.3 
 
 		 452 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  49.08 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  48.49 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  45.6 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  46.64 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  45.13 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  43.75 
 
 		 470 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  43.97 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  50.12 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  45.19 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  44.49 
 
 		 450 aa  355  7.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  40.82 
 
 		 493 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  40.91 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  42.14 
 
 		 467 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  43.03 
 
 		 421 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  40.56 
 
 		 425 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  40.19 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  39.58 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  26.08 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 699 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  26.54 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  21.22 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 349 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  25.54 
 
 		 393 aa  93.2  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 342 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  20.95 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 		 386 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  20.95 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  22.92 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.49 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.49 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.49 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.49 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.49 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.04 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  23.25 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  22.51 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  21.51 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.04 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  28.17 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  26.9 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 349 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.36 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  28.03 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  27.83 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.03 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.23 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  21.77 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  25.25 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.64 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  24.47 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>