More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6634 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  98.18 
 
 
385 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
385 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  81.35 
 
 
386 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  71.73 
 
 
393 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  44.04 
 
 
390 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  28.54 
 
 
421 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  28.3 
 
 
421 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 
404 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
377 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
427 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 
393 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 
429 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
390 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 
425 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  25.63 
 
 
403 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 
420 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  24.46 
 
 
390 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
425 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 
403 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  26.01 
 
 
455 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 
416 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  27.95 
 
 
444 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.54 
 
 
450 aa  99.8  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  24.69 
 
 
400 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
414 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  23.78 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  23.96 
 
 
493 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  25.5 
 
 
421 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
470 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  26.36 
 
 
474 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.3 
 
 
495 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  25.4 
 
 
478 aa  93.2  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 
496 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  28 
 
 
500 aa  93.2  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
440 aa  90.5  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  23.58 
 
 
427 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
337 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 
699 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  23.63 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  23.97 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.63 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  37.61 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  29.47 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.33 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2759  putative oxidoreductase  28.64 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0161834 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  21.23 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1939  oxidoreductase-like  31.41 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  27.96 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  35.83 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  29.05 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  30.54 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  29.27 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  33.09 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  28.71 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  27.62 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  28.71 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  28.71 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.8 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  28.71 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  28.71 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  29.03 
 
 
377 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.42 
 
 
337 aa  67  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  24.56 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  22.42 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 
458 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
715 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>