More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4983 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
414 aa  856    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  53.43 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  54.99 
 
 
414 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  47.61 
 
 
478 aa  379  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  46.23 
 
 
421 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  45.99 
 
 
421 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  40.87 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  40.97 
 
 
421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  40.29 
 
 
420 aa  296  6e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  38.5 
 
 
464 aa  289  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  40.44 
 
 
400 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
416 aa  262  6.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02866  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11840)  31.08 
 
 
559 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  35.35 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  29.79 
 
 
421 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
699 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 
393 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  26.38 
 
 
444 aa  106  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 
429 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
425 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
442 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
425 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
385 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
431 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
431 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  26.61 
 
 
390 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  27.41 
 
 
393 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
397 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  35.68 
 
 
375 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  24.62 
 
 
455 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 
390 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
358 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
391 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  25.26 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 
345 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  31.31 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  26.59 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  25.98 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.85 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 
470 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.85 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  24.25 
 
 
495 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
358 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.31 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  28.16 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  31.61 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  32.65 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.9 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  24.09 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  27.44 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  26.85 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  26.29 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.05 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 
347 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.12 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>