More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2449 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  93.35 
 
 		 404 aa  740    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 377 aa  782    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  62.33 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  35.2 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1939  oxidoreductase-like  36.24 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2759  putative oxidoreductase  32.23 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0161834 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  23.46 
 
 		 444 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  27.05 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  25.41 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  21.83 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  22.57 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  25.49 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 330 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  31.52 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  25.94 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  30.98 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  23.96 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  28.63 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  30.65 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  25.21 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  28.22 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  22.3 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  23.36 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  25.22 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.07 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.13 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  27.63 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  24.9 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.87 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.87 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.34 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  22.16 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  28.42 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.83 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.75 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.87 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.87 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  23.59 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  28.79 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  27.76 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  28.79 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  28.79 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  23.59 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  28.79 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  29.39 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  25.33 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.28 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  23.44 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.28 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.6 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.28 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  29.41 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.79 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  29.44 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  22.56 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  24.41 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  29.44 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  28.79 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>