More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1939 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1939  oxidoreductase-like  100 
 
 
361 aa  745    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  63.09 
 
 
368 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2759  putative oxidoreductase  62.78 
 
 
373 aa  434  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0161834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  52.6 
 
 
380 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  34.88 
 
 
403 aa  222  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 
404 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  36.51 
 
 
377 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.85 
 
 
331 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  27.84 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.83 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  30.96 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  30.54 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  27.73 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  27.1 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25.14 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  27.31 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  27.31 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.72 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.07 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  27.31 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  24.72 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  24.72 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.34 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.67 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  25.21 
 
 
327 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.07 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  24.51 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  23.65 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  25.21 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.67 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  26.56 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  27.87 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  30.19 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  25.64 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  22.68 
 
 
347 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  27.54 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  27.23 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  21.98 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  25.85 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  22.59 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  25.97 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  23.85 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.66 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  26.36 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  26.36 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  26.36 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  23.99 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  23.53 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  27.39 
 
 
493 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  26.86 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  26.36 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  26.36 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.55 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.72 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  23.64 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  22.7 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  29.11 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  22.7 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.09 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
470 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  23.97 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  22.85 
 
 
342 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
382 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>