More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04345 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  59.93 
 
 		 310 aa  360  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  54.79 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  54.79 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  58.63 
 
 		 318 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  55.92 
 
 		 308 aa  341  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  56.77 
 
 		 323 aa  341  8e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  52.61 
 
 		 341 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  52.16 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  52.61 
 
 		 311 aa  334  9e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  58.09 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  53.47 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  53.47 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  52.53 
 
 		 309 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  52.19 
 
 		 309 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  51.86 
 
 		 308 aa  308  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  52.51 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  53.16 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  52.17 
 
 		 309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  52.17 
 
 		 309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  52.53 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  52.17 
 
 		 309 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  49.84 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  51.14 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  55.34 
 
 		 313 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  54.75 
 
 		 303 aa  298  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  50.5 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  48.81 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  48.85 
 
 		 308 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  48.51 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  41.56 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  32.34 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  35.21 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  36 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.56 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.56 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  35.77 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.56 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.56 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.56 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  26.56 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  26.9 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.53 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  24.53 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  31.52 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.69 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  25.17 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  36.61 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  38.89 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  35.61 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  37.84 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  25.91 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  32.52 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  21.98 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  36.51 
 
 		 361 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  32.52 
 
 		 346 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  33.88 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  30.21 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  21.18 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  30.08 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0245  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>