More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0745 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  43.32 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  42.81 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  45.07 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  41.75 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  46.41 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  41.5 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  43.14 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  43 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  43.79 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  43.28 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  42.53 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  42.86 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  42.07 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  42.86 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  42.86 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  42.33 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  41.78 
 
 		 341 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  41.78 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  42.67 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  43.14 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  43.79 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  44.19 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  42.07 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  40.07 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  41.04 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  40.07 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  41.56 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  43.46 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  42.28 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  42.81 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  37.07 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  43.94 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.85 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.77 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3405  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3670  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase  30.28 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  28.23 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  33.06 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  28.23 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.54 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  28.23 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  28.23 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  25.39 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  28.23 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  34.11 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.57 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.39 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  32.19 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.39 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  36.61 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.45 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.67 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  37.29 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.5 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  25.26 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.67 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.8 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  28.14 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.67 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  29.38 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.67 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.83 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  22.5 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.22 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  33.33 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  30 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  30 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  30 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 		 357 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  27.54 
 
 		 346 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  27.54 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  27.54 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  36.11 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  27.54 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  29.45 
 
 		 367 aa  52.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>