More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3670 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3670  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  687    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3405  oxidoreductase domain-containing protein  99.1 
 
 		 332 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0190  oxidoreductase domain-containing protein  56.75 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  30.5 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  34.01 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.53 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  32.16 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.27 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  29.07 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  31.53 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.1 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.22 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  28.63 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  25.86 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  26.45 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  24.54 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.98 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  33.98 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3482  oxidoreductase domain protein  39.66 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  30.81 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.32 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.5 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  32.35 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.65 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  32.02 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  33.51 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  30.61 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  32.32 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  33 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  36.73 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  31 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  35.59 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  29.21 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.17 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  27.37 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.4 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  28.95 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.42 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 1080 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  29.35 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  31.66 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  26.63 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.06 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  35.46 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  22.55 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>