More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5877 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  100 
 
 
355 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1833  oxidoreductase domain-containing protein  53.44 
 
 
376 aa  335  9e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1716  oxidoreductase domain protein  40.17 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  0.303463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24940  predicted dehydrogenase  28.77 
 
 
512 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  31.7 
 
 
358 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
362 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
362 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  38.57 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  37.8 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  37.01 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  35 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4378  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0257  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  36.21 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  45.28 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  37.29 
 
 
345 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0190  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 
331 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0579  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  34.82 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  26.18 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 
368 aa  59.3  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  34.21 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  35.29 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3482  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.55 
 
 
388 aa  56.2  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  36.07 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  36.07 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.74 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  36.07 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  36.07 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  36.61 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  22.36 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  34.31 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  35.78 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  36.07 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  36.61 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  34.86 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.18 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  32.03 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3405  oxidoreductase domain-containing protein  36.88 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  36.71 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  38.89 
 
 
355 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.79 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.06 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  38.1 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  25.45 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.77 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
476 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  25.78 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  44.68 
 
 
347 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 
344 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  32.17 
 
 
362 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 
356 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
349 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.24 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  33.33 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 
665 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  36.54 
 
 
352 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
333 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  34.51 
 
 
388 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  33.01 
 
 
368 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  39.44 
 
 
366 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3670  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase  35.46 
 
 
332 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  38.83 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  30.39 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
719 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  36.23 
 
 
349 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  33.63 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  31.25 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
377 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  35.92 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  35.85 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  28.87 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>