More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5477 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  99.03 
 
 		 309 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  95.47 
 
 		 309 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  95.47 
 
 		 309 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  95.47 
 
 		 309 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  91.91 
 
 		 309 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  92.23 
 
 		 309 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  81.55 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  71.66 
 
 		 309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  65.02 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  63.7 
 
 		 312 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  57.1 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  57.43 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  58.75 
 
 		 323 aa  351  8.999999999999999e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  59.6 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  60.07 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  58.09 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  57.79 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  54.46 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  56.11 
 
 		 341 aa  338  5.9999999999999996e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  56.11 
 
 		 311 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  55.78 
 
 		 311 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  55.12 
 
 		 310 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  57 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  51.15 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  51.49 
 
 		 308 aa  318  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  49.5 
 
 		 315 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  52.53 
 
 		 311 aa  310  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  56.25 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  51.48 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  42.53 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  27.38 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  30.81 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  34.92 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  34.92 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  34.92 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  34.92 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  34.92 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  34.92 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  30.13 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  34.65 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  34.92 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  34.13 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  37.1 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  29.73 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.79 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  29.37 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.06 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  25.38 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.37 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  38.33 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  37.5 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.37 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  27.98 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.65 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.37 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  25.51 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  27.59 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  27.59 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  27.59 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.87 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.84 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  34.85 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  38.14 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.21 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>