More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0193 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 		 311 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  63.23 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  62.58 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  60 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  29.32 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  29.94 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.3 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.71 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.34 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.16 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.8 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.03 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.03 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.8 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.12 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  29.84 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.84 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  29.84 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  29.84 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  29.13 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  29.21 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  28.8 
 
 		 307 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  28.8 
 
 		 307 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  28.8 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  28.8 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  29.84 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  28.62 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  24.28 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  26.42 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  24.65 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  37.6 
 
 		 715 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  28.92 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  34.18 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 699 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  29.73 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  32.54 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.45 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  35.17 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0190  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  27.75 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  25.11 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  32.57 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  29.65 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  27.56 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  31.43 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.13 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.3 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  26.53 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  24.67 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  23.83 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  28.32 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  34.15 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  34.15 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.28 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 		 719 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  27.22 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4378  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>