More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1162 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  50.17 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  50.67 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  45.27 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  28.66 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  28.01 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.92 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  33.45 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.32 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.64 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.8 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.25 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  31.09 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.99 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.92 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.92 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  32.16 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.1 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.34 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  31.8 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  31.8 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  31.45 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  31.45 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  31.45 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  26.94 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  31.17 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  31.49 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  31.17 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  31.1 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  30.84 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  30.84 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  28.01 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 		 335 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  28.09 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 724 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  29.73 
 
 		 338 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  33.56 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.34 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  25.13 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  41.89 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  25.68 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 		 368 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.66 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  27.14 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  25.85 
 
 		 340 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1467  oxidoreductase-like  26.8 
 
 		 357 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.795298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 332 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  52.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  26.09 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.39 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.68 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  24.41 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.5 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  37.17 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  23.5 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  23.5 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.72 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  23.86 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  26.71 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  27.4 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.96 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  29.13 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  22.73 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>