More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2047 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  100 
 
 		 309 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  68.21 
 
 		 306 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  61.92 
 
 		 321 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  62.33 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  62.33 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  62.33 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  62.33 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  62 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  62 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  61.67 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  62 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  61.33 
 
 		 321 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  60.73 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  60.4 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  60.4 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  59.73 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  59.73 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  60.07 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  60.46 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  58.94 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.54 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.54 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.7 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.07 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.88 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  44.74 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.36 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.88 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.88 
 
 		 308 aa  305  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.88 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  33.66 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  29.84 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  33.88 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.94 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  31.23 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  30.58 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  25.77 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  23.48 
 
 		 353 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.44 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 356 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 356 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.48 
 
 		 353 aa  89  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  23.85 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.49 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  29.97 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  27.3 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  22.74 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  24.3 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.83 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  24.3 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  23 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  20.47 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.49 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.57 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.49 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.74 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  23.13 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  31.76 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  24.38 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  23.9 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  23.58 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  24.92 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  23.43 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  25.08 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  24.1 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.44 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  23.99 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  22.36 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  23.98 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>