More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2061 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  100 
 
 		 307 aa  633  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  99.02 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  99.02 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  99.02 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  98.37 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  98.05 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  97.72 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  97.39 
 
 		 307 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  80.78 
 
 		 307 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  80.46 
 
 		 307 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  80.46 
 
 		 307 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  80.46 
 
 		 307 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  80.13 
 
 		 307 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  76.22 
 
 		 307 aa  510  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  63.16 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  62 
 
 		 309 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  59.33 
 
 		 321 aa  362  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  58.22 
 
 		 321 aa  359  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  58.14 
 
 		 305 aa  348  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  56.54 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42.62 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42.43 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.11 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.11 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.97 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.11 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  42.3 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.64 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  41.97 
 
 		 308 aa  268  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42.52 
 
 		 308 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  36.52 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  31.27 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  29.39 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  26.86 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.84 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  28.18 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.81 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.53 
 
 		 354 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  26.67 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  22.19 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.43 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.14 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  25.85 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.14 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  32.87 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  20.94 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.32 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.27 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  23.17 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 		 359 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  24 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  22.86 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.46 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  26.69 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  23.05 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  21.28 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  21.07 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  22.7 
 
 		 721 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.46 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.59 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>