More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7457 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  738    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  32.22 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4378  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  31.7 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02013  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10190)  24.81 
 
 		 397 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0246485  normal  0.744051 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  33.08 
 
 		 715 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0579  oxidoreductase domain-containing protein  33.82 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  28.99 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.73 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.97 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.16 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.08 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  29.2 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  37.06 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  37.06 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  37.06 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.93 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  37.06 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  37.06 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.37 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.93 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.93 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0257  oxidoreductase domain protein  34.56 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.25 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  30.41 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  30.41 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  31.43 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  31.43 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  31.43 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  31.43 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.05 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  31.43 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.38 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  32.87 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32.87 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  32.87 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  32.87 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  32.09 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  32.87 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  29.21 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  30.28 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  32.87 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.59 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  27.74 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.47 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.99 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  32.17 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1716  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  0.303463 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.47 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.47 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  28.14 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  30.88 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.74 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  31.54 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  36.56 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>