More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1716 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1716  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  0.303463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  40.17 
 
 		 355 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1833  oxidoreductase domain-containing protein  34.63 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24940  predicted dehydrogenase  28.1 
 
 		 512 aa  97.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 362 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.81 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  25.82 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  30.05 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  30.54 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  28.77 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  26.13 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  29.5 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.44 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  24.78 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  28.7 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.78 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 712 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  23.21 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 734 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  29.76 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  31.03 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.75 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.88 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.3 
 
 		 388 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  30.63 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.14 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.9 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  29.66 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.15 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  30.82 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.67 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  36.43 
 
 		 432 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  28.22 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.78 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  28.97 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  29.9 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  24.01 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4378  oxidoreductase domain protein  23.72 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  28.78 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.49 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  33.08 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  36.19 
 
 		 715 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3288  oxidoreductase domain protein  40.52 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0190  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.46 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.78 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0579  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  32.03 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  27.93 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>