More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3288 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3288  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 374 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  55.12 
 
 		 376 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1660  oxidoreductase domain-containing protein  57.98 
 
 		 364 aa  347  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4840  oxidoreductase domain-containing protein  57.34 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  51.82 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.64 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.86 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2066  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  33.16 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.37 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  30.8 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  32.29 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  23.61 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  33.98 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  40.51 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  30.05 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  33.12 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.28 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  30.09 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  33.79 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.16 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.89 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  34.17 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.16 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  39.57 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  40.65 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.08 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.17 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.95 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.17 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.36 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  24.65 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  34.39 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.17 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.17 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>