More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2066 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2066  oxidoreductase-like  100 
 
 		 358 aa  702    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  33.45 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1660  oxidoreductase domain-containing protein  34.49 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3288  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4840  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  32.38 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  21.82 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116249 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2174  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193543  decreased coverage  0.00937505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  33.16 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0522  putative oxidoreductase  31.27 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3247  oxidoreductase domain-containing protein  34.52 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118783  normal  0.512873 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.6 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  27 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  27.2 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.43 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0906  oxidoreductase domain-containing protein  27.18 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  35.6 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  32.83 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  31.94 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4937  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  23.83 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.04 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.31 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  29.08 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  28.71 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  28.19 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  38.39 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  34.58 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  22.39 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 		 746 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>