More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4840 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4840  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 416 aa  800    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  65.93 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1660  oxidoreductase domain-containing protein  67.87 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  60.67 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3288  oxidoreductase domain protein  57.46 
 
 		 374 aa  348  8e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  31.02 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 369 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 355 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2066  oxidoreductase-like  31.37 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.73 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 359 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  28.51 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  28.51 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  28.51 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  28.28 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.1 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.37 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  26.58 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  32.02 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  26.45 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.9 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 355 aa  67  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  28.96 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  34.66 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  29.15 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  23.8 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  30 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1479  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  29.6 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  30.11 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  28.65 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  27.65 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  26.7 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  37.41 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  30.06 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  30.28 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>