181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1833 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1833  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
376 aa  750    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  53.44 
 
 
355 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1716  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  0.303463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24940  predicted dehydrogenase  29.52 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
362 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  24.53 
 
 
362 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4378  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  24.37 
 
 
358 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.23 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
359 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
359 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 
337 aa  59.7  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  35.54 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 
311 aa  58.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 
374 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.18 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
335 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.14 
 
 
353 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 
384 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 
377 aa  56.2  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 
384 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  35.05 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  35.05 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.97 
 
 
350 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  28.14 
 
 
336 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  36.94 
 
 
355 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.12 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.57 
 
 
308 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.71 
 
 
308 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  30.77 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  30.77 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.71 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.03 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  30.77 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  31.33 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 
346 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 
346 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.03 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.04 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.03 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  35.46 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2847  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.03 
 
 
308 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
344 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 
344 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  31.54 
 
 
338 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
352 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  34.43 
 
 
337 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  27.54 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  31.13 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  35.61 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  27.52 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  33.33 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  24.81 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  34.65 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.71 
 
 
310 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  32.23 
 
 
421 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0257  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.92 
 
 
288 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  34.51 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
305 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3670  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase  33.8 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  30.97 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3405  oxidoreductase domain-containing protein  35.94 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  28.3 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>