More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1805 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
321 aa  663    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  90.65 
 
 
321 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  67.11 
 
 
306 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  61.33 
 
 
309 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  61.62 
 
 
307 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  61.62 
 
 
307 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  63.33 
 
 
307 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  62.29 
 
 
307 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  61.95 
 
 
307 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  62.29 
 
 
307 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  62.33 
 
 
305 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  60.94 
 
 
307 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  60.33 
 
 
307 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  60 
 
 
307 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  60 
 
 
307 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  60 
 
 
307 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  60 
 
 
307 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  59 
 
 
307 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  59.33 
 
 
307 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  59.33 
 
 
307 aa  362  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.02 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.02 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.02 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  46.86 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  47.51 
 
 
308 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  47.51 
 
 
308 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  47.02 
 
 
308 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.69 
 
 
308 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  47.51 
 
 
308 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.69 
 
 
308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  33.22 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  35.18 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  32.27 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 
308 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  35.31 
 
 
297 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.21 
 
 
311 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  30.19 
 
 
310 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 
309 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  30.19 
 
 
310 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  27.76 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
320 aa  106  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 
360 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.51 
 
 
345 aa  95.9  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.44 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 
355 aa  92.8  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  35.23 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.58 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  29.6 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  31.25 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  31.25 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  33.52 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 
334 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 
359 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
347 aa  86.3  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
344 aa  85.9  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 
356 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 
356 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  29.24 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  28.8 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  26.77 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.58 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  26.83 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  28.99 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.78 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  21.85 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  25.23 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  26.22 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.77 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  27.36 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.89 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  25.5 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>