More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2847 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2847  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2497  oxidoreductase domain-containing protein  87.9 
 
 		 372 aa  669    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  42.86 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  36.59 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.68 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  34.93 
 
 		 337 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.06 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  22.93 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  33.49 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  34.74 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.91 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 644 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  27.63 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  33.54 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  30.09 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  24.9 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  24.9 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.25 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.58 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.1 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.92 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  24.5 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  32.6 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.5 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.28 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  35.27 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  25.84 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  24.93 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  25.84 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  22.4 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  25.84 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  25.84 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  24.56 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.86 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  36.67 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3617  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  25.84 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  29.5 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>