More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1237 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  100 
 
 
307 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  99.67 
 
 
307 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  99.02 
 
 
307 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  99.02 
 
 
307 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  99.02 
 
 
307 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  81.11 
 
 
307 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  81.11 
 
 
307 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  80.78 
 
 
307 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  81.11 
 
 
307 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  80.46 
 
 
307 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  80.13 
 
 
307 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  79.8 
 
 
307 aa  524  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  80.13 
 
 
307 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  75.57 
 
 
307 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  64.47 
 
 
306 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  61.62 
 
 
321 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  60.4 
 
 
309 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  60.53 
 
 
321 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  60.47 
 
 
305 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  59.15 
 
 
307 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.41 
 
 
308 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.41 
 
 
308 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  43.42 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.42 
 
 
308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.42 
 
 
308 aa  281  9e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42.95 
 
 
308 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.62 
 
 
308 aa  278  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  42.62 
 
 
308 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42.3 
 
 
308 aa  275  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  42.86 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  37.28 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
305 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
308 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  31.83 
 
 
310 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  28.26 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
294 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  27.5 
 
 
310 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.13 
 
 
311 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  27.1 
 
 
305 aa  105  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 
360 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.45 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
335 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
353 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.36 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.98 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  32.04 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  39.86 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  23.64 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  37.06 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  21.67 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.49 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  22.77 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  29.05 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.63 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.35 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  31.94 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  31.94 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  32.11 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  32.11 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  31.94 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32.11 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.96 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.58 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  34.33 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  22.57 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.78 
 
 
343 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  21.32 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.14 
 
 
388 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.51 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.96 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  29.45 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>