More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4046 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4046  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.131768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3670  oxidoreductase domain-containing protein  86.6 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  56.86 
 
 		 319 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4385  oxidoreductase domain protein  47.1 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0112  oxidoreductase domain protein  48.11 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37800  predicted dehydrogenase  40.7 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0245  oxidoreductase domain protein  40.07 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1102  oxidoreductase domain protein  45.17 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0783958  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2521  putative oxidoreductase protein  38.33 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2113  oxidoreductase domain protein  39.93 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  36.57 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  42.75 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  37.9 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.94 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  31.79 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  31.96 
 
 		 346 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  31.96 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  31.96 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  31.96 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  31.96 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  31.44 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  31.68 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  29.32 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  29.32 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  29.32 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  38.84 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.26 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.39 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.47 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  35.77 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  35.03 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  29.9 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  32.64 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  29.9 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  29.9 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  32.28 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  29.9 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  32.8 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.8 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  33.61 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  29.38 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  32.8 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  29.9 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  29.69 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  29.19 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.37 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  28.27 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  36.6 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  34.15 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  29.38 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.95 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  32.98 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  28.4 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  33.61 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.13 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 667 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.2 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  32.62 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.2 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  39.74 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>