More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4385 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4385  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 298 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4046  oxidoreductase domain-containing protein  47.1 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.131768 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  46.15 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3670  oxidoreductase domain-containing protein  46.13 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37800  predicted dehydrogenase  43.07 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0112  oxidoreductase domain protein  44.3 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1102  oxidoreductase domain protein  47.75 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0783958  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0245  oxidoreductase domain protein  40.79 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2521  putative oxidoreductase protein  37.19 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2113  oxidoreductase domain protein  40.36 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 		 369 aa  86.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  39.02 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  37.7 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  29.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  29.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  29.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.1 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  33.88 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.47 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.47 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.47 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  28.79 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  34.04 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  32.57 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.78 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  38.71 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  33.88 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  36.27 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  36.3 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  34.87 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.64 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  37.9 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  36.8 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  29.18 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  31.52 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  37.29 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  23.45 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  39.02 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  28.4 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  34.96 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  37.4 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  28.4 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  28.4 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  28.4 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.48 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  39.47 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  28.4 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.5 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  38.74 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  31.13 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.42 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.58 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.58 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  24.62 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  34.8 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  23.83 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  30.23 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.65 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  23.83 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.16 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  38.28 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  39.06 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.16 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.65 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  28.68 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  29.67 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  29.62 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25.52 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  27.24 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  27.24 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  27.24 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>