More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0112 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0112  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 299 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  47.62 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4046  oxidoreductase domain-containing protein  48.11 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.131768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3670  oxidoreductase domain-containing protein  47.42 
 
 		 306 aa  235  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37800  predicted dehydrogenase  39.86 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4385  oxidoreductase domain protein  43.77 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0245  oxidoreductase domain protein  42.47 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1102  oxidoreductase domain protein  42.47 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0783958  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2113  oxidoreductase domain protein  41.78 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2521  putative oxidoreductase protein  34.77 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 365 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  41.03 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  36.72 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.08 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  35.16 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  29.01 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.69 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  41.94 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 		 353 aa  68.9  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  38.26 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  37.4 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  34.4 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  27.27 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.48 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.5 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  37.14 
 
 		 667 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.98 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.9 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.08 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  33.68 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  32.37 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65576  predicted protein  24.34 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  31.15 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  32.39 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.48 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  27.14 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.48 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  32.76 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  29.9 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  26.09 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.26 
 
 		 438 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.06 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  30.61 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  31.12 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  27.65 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.7 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  43.43 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  30.14 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  27.65 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  31.7 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.79 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  37.21 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  26.85 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>