More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2113 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2113  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 294 aa  567  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0245  oxidoreductase domain protein  46.53 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37800  predicted dehydrogenase  44.75 
 
 		 296 aa  221  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2521  putative oxidoreductase protein  44.09 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3670  oxidoreductase domain-containing protein  40.14 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4046  oxidoreductase domain-containing protein  40.65 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.131768 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  37.68 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4385  oxidoreductase domain protein  40.36 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0112  oxidoreductase domain protein  41.44 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1102  oxidoreductase domain protein  38.63 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0783958  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.84 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.52 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  30.24 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.2 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  34.76 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.08 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  27.15 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  30.58 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.11 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  31.09 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.95 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  34.95 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 		 387 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.68 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  29.8 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  30.05 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  34.38 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.02 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  28.72 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.13 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  35.25 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.13 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.13 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  34.92 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  28.38 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  29.95 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  27.72 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  26.24 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  29.26 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.43 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  26.24 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  26.24 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  26.24 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  31.76 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  33.57 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>