More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1754 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  697    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  32.53 
 
 
387 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 
380 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 
387 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  33.95 
 
 
378 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 
378 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.01 
 
 
378 aa  132  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 
389 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 
390 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
366 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
377 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
377 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 
385 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.03 
 
 
382 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
370 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
377 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  30.08 
 
 
377 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.08 
 
 
377 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 
382 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.68 
 
 
369 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
389 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.71 
 
 
381 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
388 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
381 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
382 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  25.53 
 
 
386 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.68 
 
 
386 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 
396 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 
377 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 
365 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 
376 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  30.3 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  28.3 
 
 
396 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.6 
 
 
377 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 
382 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 
352 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  28.83 
 
 
394 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 
389 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
398 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
398 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
398 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
353 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
384 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  29.77 
 
 
367 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  27.08 
 
 
396 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
403 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.1 
 
 
371 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
398 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
388 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
413 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
387 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 
378 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  27.32 
 
 
393 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 
359 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
384 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 
390 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
348 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.1 
 
 
371 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  27.46 
 
 
367 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
370 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.1 
 
 
349 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
378 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 
387 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
373 aa  102  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  26.6 
 
 
360 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
330 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.84 
 
 
382 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
378 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 
418 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
397 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
377 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
393 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>