More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37800  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0245  oxidoreductase domain protein  56.01 
 
 		 296 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2113  oxidoreductase domain protein  42.72 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3670  oxidoreductase domain-containing protein  41.05 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2521  putative oxidoreductase protein  43.21 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4046  oxidoreductase domain-containing protein  40.7 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.131768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4385  oxidoreductase domain protein  43.07 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0112  oxidoreductase domain protein  39.86 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 		 319 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1102  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0783958  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 345 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  33.17 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  34.09 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  33.75 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  34.07 
 
 		 396 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  34.32 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.33 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.79 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.79 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.88 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.67 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  35.03 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  33.46 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  33.9 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  29.44 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  34.4 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  35.54 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.31 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.71 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  39.2 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.52 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  31.2 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 377 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 377 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 385 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.47 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.45 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.53 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  30.98 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.53 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  31.16 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.45 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  41.07 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  30.24 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  30.91 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  35.97 
 
 		 667 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  27.24 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.84 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2895  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.46 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  32.32 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  35.96 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  37.06 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.61 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  31.44 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>