More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2766 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  73.82 
 
 
318 aa  408  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 
320 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.71 
 
 
317 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  39.49 
 
 
322 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.75 
 
 
319 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  37.14 
 
 
310 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  36.62 
 
 
319 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  36.51 
 
 
314 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  38.61 
 
 
312 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  37.46 
 
 
318 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  35.13 
 
 
313 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  37.14 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  35.9 
 
 
327 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  35.9 
 
 
327 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  35.78 
 
 
353 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.83 
 
 
310 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 
326 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  35.6 
 
 
649 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  36.42 
 
 
331 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 
355 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  33.44 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  33.44 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  36.45 
 
 
334 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  36.86 
 
 
337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  37.26 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  35.83 
 
 
340 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  36.13 
 
 
359 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  34.85 
 
 
346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  36.28 
 
 
335 aa  162  9e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  36.89 
 
 
334 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  35.2 
 
 
340 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  36.91 
 
 
340 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  36.13 
 
 
354 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  35.22 
 
 
334 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  33.12 
 
 
319 aa  159  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  34.84 
 
 
360 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  35.39 
 
 
334 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  34.91 
 
 
334 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  35.96 
 
 
335 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  36.57 
 
 
327 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 
344 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.93 
 
 
352 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  36.66 
 
 
323 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 
356 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 
356 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.36 
 
 
345 aa  153  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  36.51 
 
 
356 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  32.22 
 
 
353 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  35.58 
 
 
327 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 
341 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 
331 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
320 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 
321 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  32.29 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 
303 aa  146  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.82 
 
 
332 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  37.38 
 
 
326 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  31.61 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  32.52 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.35 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 
359 aa  139  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  31.58 
 
 
332 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  34.65 
 
 
309 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 
361 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  38.63 
 
 
347 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  34.49 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.71 
 
 
313 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.48 
 
 
310 aa  125  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  31.72 
 
 
305 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 
344 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 
361 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  32.82 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  36.75 
 
 
306 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  28.62 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  29.65 
 
 
332 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 
344 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.01 
 
 
317 aa  105  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
343 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  29.02 
 
 
328 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
344 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
343 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  29.97 
 
 
340 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  23.72 
 
 
302 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 
352 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
381 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.44 
 
 
332 aa  99  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  30.8 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>