More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3750 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  100 
 
 
649 aa  1319    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  54.37 
 
 
310 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  53.72 
 
 
313 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.81 
 
 
317 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  55.52 
 
 
316 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.75 
 
 
310 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  50.49 
 
 
318 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  49.84 
 
 
314 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  50.33 
 
 
322 aa  302  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  50 
 
 
327 aa  298  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  50 
 
 
327 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  48.26 
 
 
320 aa  296  8e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  48.26 
 
 
320 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  50.16 
 
 
337 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.04 
 
 
319 aa  277  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  49.68 
 
 
312 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  46.33 
 
 
331 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1375  hypothetical protein  51.89 
 
 
288 aa  256  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000871979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  42.04 
 
 
321 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2839  hypothetical protein  46.07 
 
 
273 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3376  protein of unknown function DUF1009  46.74 
 
 
270 aa  251  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  43.45 
 
 
346 aa  251  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0897  hypothetical protein  45.16 
 
 
278 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  41.8 
 
 
319 aa  243  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3002  protein of unknown function DUF1009  51.31 
 
 
281 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 
341 aa  241  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  41.08 
 
 
320 aa  240  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  39.69 
 
 
326 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1125  hypothetical protein  47.33 
 
 
271 aa  233  9e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.33509  decreased coverage  0.00103642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  44.78 
 
 
347 aa  227  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1086  hypothetical protein  46.18 
 
 
268 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1145  protein of unknown function DUF1009  46.18 
 
 
268 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1214  protein of unknown function DUF1009  46.18 
 
 
268 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  45.48 
 
 
326 aa  224  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  36.57 
 
 
355 aa  223  7e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4554  hypothetical protein  42.61 
 
 
301 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.0581006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2359  protein of unknown function DUF1009  42.07 
 
 
294 aa  218  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2226  protein of unknown function DUF1009  42.65 
 
 
278 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.212193  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  37.94 
 
 
319 aa  211  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1852  hypothetical protein  43.13 
 
 
278 aa  210  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000781514  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17540  hypothetical protein  41.22 
 
 
272 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  35.8 
 
 
353 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.09 
 
 
345 aa  201  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  34.82 
 
 
344 aa  200  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  41.91 
 
 
313 aa  197  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  41.91 
 
 
313 aa  197  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0371  protein of unknown function DUF1009  39.92 
 
 
267 aa  196  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0143196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
315 aa  193  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  34.42 
 
 
344 aa  192  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 
359 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  33.76 
 
 
354 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  33.86 
 
 
353 aa  189  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
356 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
356 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
355 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.17 
 
 
352 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0079  hypothetical protein  38.52 
 
 
273 aa  184  4.0000000000000006e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000676342  hitchhiker  0.00000000000219127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 
360 aa  183  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 
340 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  33.99 
 
 
356 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
359 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  33.86 
 
 
335 aa  174  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
334 aa  173  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  32.92 
 
 
334 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  33.12 
 
 
334 aa  170  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  33.54 
 
 
335 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  33.12 
 
 
334 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2350  protein of unknown function DUF1009  33.84 
 
 
268 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  33.97 
 
 
344 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  32.17 
 
 
340 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 
327 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 
320 aa  164  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0884  protein of unknown function DUF1009  34.88 
 
 
287 aa  163  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  31.85 
 
 
340 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  32.28 
 
 
340 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  31.96 
 
 
334 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  33.98 
 
 
323 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  34.58 
 
 
334 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 
327 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  34.3 
 
 
317 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 
344 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  32.06 
 
 
346 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  34.81 
 
 
309 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 
311 aa  151  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2040  hypothetical protein  34.56 
 
 
299 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.229443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
361 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1108  hypothetical protein  33.21 
 
 
300 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3873  hypothetical protein  38.15 
 
 
281 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.429993  normal  0.0170553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  31.49 
 
 
332 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1150  hypothetical protein  32.5 
 
 
300 aa  145  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.02 
 
 
345 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  33.45 
 
 
305 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  30.19 
 
 
332 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
331 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  36.3 
 
 
320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1287  protein of unknown function DUF1009  35.61 
 
 
269 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0767794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 
313 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.98 
 
 
312 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
318 aa  140  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1010  protein of unknown function DUF1009  34.94 
 
 
261 aa  139  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00304045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>