More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3203 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  59.05 
 
 
319 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  58.23 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  57.28 
 
 
319 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  57.59 
 
 
319 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  55.7 
 
 
319 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  56.15 
 
 
318 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  57.28 
 
 
317 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 
318 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  56.65 
 
 
320 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  53.04 
 
 
312 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  54.17 
 
 
314 aa  362  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  54.63 
 
 
315 aa  358  9e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  52.37 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  43.17 
 
 
312 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
358 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.92 
 
 
313 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
347 aa  89.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 
312 aa  89  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  32.28 
 
 
353 aa  87  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
364 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 
362 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.78 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  27.86 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.89 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  33.83 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  21.27 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  33.83 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.11 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
374 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  31.62 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  34.09 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  30.57 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.1 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  36.97 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  24.06 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.21 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  38.06 
 
 
695 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  32.58 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.6 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  34.81 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.6 
 
 
428 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.53 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  29.41 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.29 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.47 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>