More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0171 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  80.89 
 
 
319 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  79.75 
 
 
320 aa  542  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  80.7 
 
 
318 aa  537  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  78.8 
 
 
319 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  78.48 
 
 
318 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  77.85 
 
 
319 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  78.8 
 
 
319 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  79.11 
 
 
319 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  74.04 
 
 
312 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  71.79 
 
 
314 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  68.77 
 
 
317 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  63.38 
 
 
315 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  57.28 
 
 
315 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  41.82 
 
 
312 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.05 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
359 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
359 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  28.73 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  37.09 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.64 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  30.38 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  31.65 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  34.27 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  34.27 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  34.27 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  34.27 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  34.27 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  37.3 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  31.36 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  35.76 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.7 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  33.77 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.77 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  33.77 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  33.77 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  33.77 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  33.77 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  33.77 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
374 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  28.38 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  26.5 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.72 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  24.56 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  28.35 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.69 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  28.1 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.07 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  24.76 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.21 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.88 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.15 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  29.49 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.81 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  25.64 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.66 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  28.8 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  36.52 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>