More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4569 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  67.14 
 
 		 360 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  64.31 
 
 		 360 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  63.46 
 
 		 363 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.26 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  57.26 
 
 		 352 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  56.98 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  56.41 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.98 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  57.39 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  56.7 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  54.99 
 
 		 354 aa  394  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  54.26 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  54.13 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  31.32 
 
 		 337 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  30.57 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.54 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  29.96 
 
 		 353 aa  89.7  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.21 
 
 		 312 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  25.62 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  25.83 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  30.08 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.15 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  29.65 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.66 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  30.92 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  34.93 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  27.45 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.02 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  27.71 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  29.02 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  26.84 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  27.04 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  28.36 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  31.18 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.37 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  32.65 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  29.39 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.05 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  36.3 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 715 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28.14 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  30.18 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.41 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28.78 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  29.32 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  25.61 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  27.94 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  22.4 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  25.12 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.44 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  25.12 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  26.04 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  31.58 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  33.52 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  29.58 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  26.78 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>