More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14141 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  40.13 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  31.15 
 
 
326 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  32.05 
 
 
301 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
337 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  32.05 
 
 
301 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  26.2 
 
 
333 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  29.34 
 
 
300 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  29.68 
 
 
296 aa  106  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  25.8 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  21.71 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.93 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.93 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  26.06 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.41 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.9 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.9 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 
353 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  23.62 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  25.48 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26 
 
 
345 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
333 aa  59.3  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
496 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.17 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  26 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  23.03 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  27.47 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
370 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  27.81 
 
 
316 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 
342 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.82 
 
 
334 aa  56.2  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.82 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  20.94 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  23.31 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  25 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
435 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
431 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 
384 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
444 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  27.94 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 
389 aa  53.5  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  22.52 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  22.14 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  23.31 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  22.56 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
431 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  24.32 
 
 
337 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
385 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 
350 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
381 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 
367 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  26.9 
 
 
390 aa  53.1  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  23.6 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  18.75 
 
 
342 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  23.31 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  23.17 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 
348 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  21.12 
 
 
467 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 
397 aa  52.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  24.08 
 
 
334 aa  52.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
425 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  21.43 
 
 
312 aa  52.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  26.39 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  23.62 
 
 
474 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0402  oxidoreductase, putative  26.8 
 
 
331 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.738462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 
375 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2033  oxidoreductase domain protein  20.18 
 
 
346 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  23.47 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 
375 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0345  putative oxidoreductase  26.8 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.42492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  22.14 
 
 
724 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
425 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>