200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0402 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0402  oxidoreductase, putative  100 
 
 
331 aa  676    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.738462  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0345  putative oxidoreductase  99.34 
 
 
304 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.42492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5793  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5800  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 
338 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  21.26 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3697  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  29.74 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  23.73 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1364  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  23.73 
 
 
378 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 
341 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  23.83 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2089  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  28.72 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  26.83 
 
 
375 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  26.09 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
333 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  32.49 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
401 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  29.35 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 
366 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  24.11 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  22.54 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  23 
 
 
396 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.42 
 
 
428 aa  53.1  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.63 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  22.76 
 
 
357 aa  52.8  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
340 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  22.65 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  26.8 
 
 
322 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  34.67 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 
367 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1364  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
377 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
388 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  21.58 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 
375 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 
334 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 
343 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  23.5 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  22.58 
 
 
363 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 
364 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
393 aa  49.3  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  24.43 
 
 
377 aa  49.3  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 
377 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  27.52 
 
 
390 aa  49.3  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  24.64 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.78 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  28.93 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3482  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  27.66 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  22.81 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  21.14 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4840  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  23.04 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  27.72 
 
 
386 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>