182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5793 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5793  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
339 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5800  oxidoreductase domain-containing protein  89.55 
 
 
338 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0402  oxidoreductase, putative  33.73 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.738462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3697  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
327 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0345  putative oxidoreductase  33.12 
 
 
304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.42492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  29.72 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  22.54 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  27.6 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.11 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  28.12 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
1080 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
1079 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  25.91 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  21.01 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  35 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  23.87 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 
401 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 
734 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  25.99 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
345 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 
374 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  23.88 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  25 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  24.4 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  26.67 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  33.75 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 
382 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  23.18 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  24.66 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 
378 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  30.16 
 
 
713 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 
397 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  21.99 
 
 
369 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  22.64 
 
 
333 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0344  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
400 aa  52.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
344 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 
357 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  22.14 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  22.17 
 
 
395 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  20.74 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.86 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  21.3 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  22.17 
 
 
395 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  21.62 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  23.4 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  23.36 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
721 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  26.03 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  19.43 
 
 
341 aa  50.4  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  23.11 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  24.11 
 
 
391 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  22.52 
 
 
438 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  20.09 
 
 
370 aa  49.7  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  22.91 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
699 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
358 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  20.83 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1364  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  23.43 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>