More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  100 
 
 
390 aa  803    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  64.08 
 
 
388 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  52.82 
 
 
389 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  37.6 
 
 
383 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 
376 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  32.96 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
337 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  33.08 
 
 
356 aa  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
344 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.8 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
412 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 
360 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 
360 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  33.06 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
359 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 
340 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
347 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
334 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 
349 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.2 
 
 
331 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 
357 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.89 
 
 
363 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.84 
 
 
353 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 
326 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
358 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
350 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
356 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  27.55 
 
 
345 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 
387 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
391 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 
373 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 
353 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
349 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.25 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  29.6 
 
 
347 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.74 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.23 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 
335 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 
374 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 
364 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
339 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
350 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.54 
 
 
352 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  31.73 
 
 
335 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
350 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 
359 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
357 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  29.66 
 
 
347 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
358 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
388 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  25.46 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.92 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  23.5 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  30.1 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  24.91 
 
 
366 aa  84  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1513  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  27 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  26.05 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  24.56 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  26.44 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  27.27 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  29.34 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  26.34 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  27.13 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  26.58 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  28.45 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.3 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>