More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4492 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  100 
 
 
342 aa  701    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  51.05 
 
 
339 aa  355  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  50.15 
 
 
336 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  50.74 
 
 
336 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  45.65 
 
 
342 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  42.52 
 
 
387 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  41.87 
 
 
391 aa  281  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  45.24 
 
 
338 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  43.86 
 
 
342 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  40.6 
 
 
335 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  40.18 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  40.84 
 
 
362 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  40.9 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  37.24 
 
 
357 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  38.62 
 
 
362 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  37.72 
 
 
359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  38.44 
 
 
391 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 
362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 
327 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  33.11 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  32.14 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.72 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
715 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.97 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  30.73 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0838  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  28.1 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  35.14 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  30.85 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 
429 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.13 
 
 
428 aa  67  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  30.21 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  30.21 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  30.21 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.13 
 
 
329 aa  67  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  30.21 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  30.21 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  30.21 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  27.59 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  29.45 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  38.46 
 
 
464 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.37 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 
394 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  30.96 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  31.54 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  26.85 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  32.1 
 
 
374 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  30.15 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.27 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  33.09 
 
 
357 aa  63.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.84 
 
 
350 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 
435 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.56 
 
 
335 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  30.84 
 
 
350 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  62.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
385 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  27.59 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  26.91 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.93 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  26.13 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  24.36 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.18 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 
425 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
425 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  25.55 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 
734 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>