More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3349 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 327 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  30.77 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  32.3 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  32.69 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  31.78 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  22.89 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.59 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.17 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 375 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  30.49 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.94 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.62 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4411  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.53 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27.13 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 		 669 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1698  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  24.74 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  24.74 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.9 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.85 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  32.32 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  23.22 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  26.59 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  28.9 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.12 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  37.78 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  26.42 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  27.37 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  29.01 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.73 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.94 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  33.55 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.28 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  22.75 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  28.69 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>