More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4491 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  100 
 
 
339 aa  699    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  58.26 
 
 
336 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  58.54 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  54.65 
 
 
342 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  51.22 
 
 
387 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  53.35 
 
 
391 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  51.05 
 
 
342 aa  355  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  51.62 
 
 
342 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  51.2 
 
 
338 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  47.6 
 
 
357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  48.95 
 
 
362 aa  308  9e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  47.29 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  48.17 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  48.79 
 
 
335 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  47.58 
 
 
360 aa  298  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  47.45 
 
 
335 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  42.9 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  41.49 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  22.07 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  22.07 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 
734 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
347 aa  62.8  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.06 
 
 
369 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  30.32 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  21.91 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  27.7 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.31 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  32.61 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  31.79 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  30.72 
 
 
346 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.6 
 
 
335 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
358 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 
362 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 
380 aa  59.3  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
358 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.93 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
384 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 
715 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.86 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  27.18 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
383 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 
329 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 
667 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
357 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.09 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  25.65 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  26.43 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  28.37 
 
 
355 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  29.05 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.11 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  29.05 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  29.05 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.4 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.45 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.45 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  24.45 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
389 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  25.75 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  28.23 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  25.75 
 
 
366 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  29.69 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  27.56 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  29.71 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 
364 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
381 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  26.64 
 
 
712 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.67 
 
 
353 aa  53.5  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.42 
 
 
359 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
376 aa  53.1  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>