More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0495 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  676    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  676    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  58.18 
 
 
328 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  52.89 
 
 
329 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  29.25 
 
 
337 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
337 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  28.62 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  24.92 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  26.28 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.23 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  23.7 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  23.87 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.54 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.44 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  28.72 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  28.87 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  28.72 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  24.41 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.01 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  30.77 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  25.08 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  23.17 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  22.07 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  27.69 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  28.81 
 
 
379 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  24.07 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  24.07 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  24.07 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.53 
 
 
350 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 
359 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
369 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  24.07 
 
 
345 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  24.07 
 
 
345 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.89 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  24.07 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  24.15 
 
 
332 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.03 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  24.18 
 
 
474 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.73 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.03 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  21.99 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  24.88 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  24.61 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  24.9 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  20.36 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  23.23 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  22.65 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  23.41 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  22.68 
 
 
362 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  23.25 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  21.99 
 
 
391 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
366 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  22.27 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 
496 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  23.12 
 
 
361 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  27.41 
 
 
373 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  24.35 
 
 
352 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.17 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  25.65 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.42 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
425 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  20.96 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  24.43 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 
425 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  22.94 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>