263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0049 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 391 aa  807    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  70.83 
 
 		 387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  60.78 
 
 		 342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  56.29 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  53.35 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  52.25 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  52.12 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  47.48 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  45.24 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  42.12 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  45.73 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  45.95 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  45.48 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  44.74 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  42.05 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  41.87 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  39.88 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 327 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  23.55 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  22.78 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  25.39 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  25.37 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  26.02 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  24.89 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  24.35 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  23.83 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  25.77 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.16 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  25 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  25 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  25 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  25 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  25.68 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  24.48 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  25 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  24.05 
 
 		 355 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  23.68 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  23.96 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  22.15 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  25.37 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  23.11 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.54 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  25 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  23.96 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  23.96 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  23.96 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  23.96 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  23.96 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  26.14 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  22.66 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  22.44 
 
 		 715 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  23.79 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  23.48 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  23.49 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  21.35 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  23.98 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  23.98 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  23.98 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  23.51 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  23.51 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  21.58 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 		 329 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  22.71 
 
 		 496 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.83 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  23.35 
 
 		 341 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 		 333 aa  53.5  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  20.97 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  25.14 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  22.44 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  25 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 		 476 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0838  oxidoreductase domain-containing protein  24.33 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  20.6 
 
 		 337 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  20.75 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  22.26 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0358  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.56 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.55 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  23.7 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>