33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1230 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  100 
 
 		 296 aa  578  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  59.27 
 
 		 301 aa  351  8e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  59.6 
 
 		 301 aa  350  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  39.27 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  27.5 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  25.8 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  29.68 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  26.61 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  26.07 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  22.19 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0797  oxidoreductase, NAD-binding  28.42 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0692  NADH-dependent dehydrogenase  27.87 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  24.43 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  18.75 
 
 		 357 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  25.93 
 
 		 390 aa  49.3  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  21.95 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  21.36 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3940  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 316 aa  45.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0963887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 416 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  20.47 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  19.94 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.36 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.81 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0052  thiazole biosynthesis protein ThiH  22.71 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.68 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>