More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1707 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  100 
 
 		 384 aa  760    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  67.83 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  55.65 
 
 		 681 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  50.94 
 
 		 383 aa  315  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  46.09 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  42.04 
 
 		 700 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  46.3 
 
 		 703 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  43.47 
 
 		 696 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  39.27 
 
 		 669 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  40.27 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  39.24 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.16 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.41 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  31.85 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.69 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  23.84 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  33.57 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.28 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  33.57 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  21.99 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  25 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  22.6 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  24.41 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  22.53 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  37.97 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  26.62 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  23.79 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  24.89 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  35.44 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 444 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  24.19 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  24.16 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  39.51 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.74 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1762  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  23.74 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  26.97 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.25 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  30.19 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  22.35 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.97 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  35.53 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  36.71 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  39.77 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  36.71 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  27.63 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.76 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  36.71 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>